Concepts 3.0 : Différence entre versions
m |
m |
||
Ligne 2: | Ligne 2: | ||
<pre>source s.ssmuse.dot nemo | <pre>source s.ssmuse.dot nemo | ||
s'assurer que $HOME/data/$TRUE_HOST existe et n'est pas sur le même "filesystem" que $HOME | s'assurer que $HOME/data/$TRUE_HOST existe et n'est pas sur le même "filesystem" que $HOME | ||
+ | |||
+ | true_path -n $HOME | ||
+ | et | ||
+ | true_path -n $HOME/data/$TRUE_HOST | ||
+ | ne devraient pas commencer de la même manière | ||
+ | |||
+ | exemple OK: | ||
+ | [user]$ true_path -n $HOME | ||
+ | /sb/home/user | ||
+ | [user]$ true_path -n $HOME/data/$TRUE_HOST | ||
+ | /gs/project/ugh-612-aa/user/guillimin | ||
+ | |||
+ | exemple PAS OK: | ||
+ | [user]$ true_path -n $HOME | ||
+ | /sb/home/user | ||
+ | [user]$ true_path -n $HOME/data/$TRUE_HOST | ||
+ | /sb/home/user/data/guillimin | ||
+ | |||
+ | |||
+ | s'assurer que le repertoire $HOME/CONCEPTS_3.0.0 n'existe pas déjà | ||
+ | |||
NOTES: | NOTES: | ||
- nemo coexiste mal avec d'autres packages. | - nemo coexiste mal avec d'autres packages. |
Version depuis le 15 d'octobre 2014 à 15:44
SETUP NEMO/OPA avec concepts 3.0
source s.ssmuse.dot nemo s'assurer que $HOME/data/$TRUE_HOST existe et n'est pas sur le même "filesystem" que $HOME true_path -n $HOME et true_path -n $HOME/data/$TRUE_HOST ne devraient pas commencer de la même manière exemple OK: [user]$ true_path -n $HOME /sb/home/user [user]$ true_path -n $HOME/data/$TRUE_HOST /gs/project/ugh-612-aa/user/guillimin exemple PAS OK: [user]$ true_path -n $HOME /sb/home/user [user]$ true_path -n $HOME/data/$TRUE_HOST /sb/home/user/data/guillimin s'assurer que le repertoire $HOME/CONCEPTS_3.0.0 n'existe pas déjà NOTES: - nemo coexiste mal avec d'autres packages. - ce raccourci charge tous les éléments nécessaires à la production d'un exécutable. - la présence d'autres éléments logiciels peut facilement entrer en conflit avec les besoins de nemo et créer des erreurs de toutes sortes. install_concepts.ksh install_concepts.ksh -arch /bin/rm -rf $HOME/CONCEPTS_3.0.0/nemo3_1_cmc/modipsl/modeles/NEMO/WORK vi $HOME/CONCEPTS_3.0.0/nemo3_1_cmc/modipsl/modeles/UTIL/fait_config # refaire config de code, pas necessaire pour cfg standard vi $HOME/CONCEPTS_3.0.0/nemo3_1_cmc/modipsl/util/AA_make.gdef #params generaux de compilation selon les architectures (en mode couple, ca prend #-Q- linux64 ARMN_LIB= -lrpn_comm_40510 -lrmn_013 -lmassvp4 ou l'equivalent) cd $HOME/CONCEPTS_3.0.0/nemo3_1_cmc/modipsl/modeles/UTIL fait_config CMC # ajustement de WORK cd $HOME/CONCEPTS_3.0.0/nemo3_1_cmc/modipsl/modeles/NEMO ../UTIL/fait_AA_make # aller prendre un cafe vi $HOME/CONCEPTS_3.0.0/nemo3_1_cmc/modipsl/config/CMC/scripts/BB_make.ldef # changer seulement les clefs de compilation prendre ORCA2 comme demo cd $HOME/CONCEPTS_3.0.0/nemo3_1_cmc/modipsl/util clr_make ins_make -t linux64 # (-t linux, -t aixp7) cd $HOME/CONCEPTS_3.0.0 . linkme cd $HOME/CONCEPTS_3.0.0/nemo3_1_cmc/modipsl/config/CMC # premiere compilation cd $HOME/CONCEPTS_3.0.0/nemo3_1_cmc/modipsl/modeles/NEMO/WORK # nemo seulement make clean # (gmake sur systemes autres que linux) make all
Changement de clefs define seulement ==> Refaire a partir de clr_make et ins_make
Ajout de nouvelles clefs ou nouveaux modules ==> Refaire a partir de fait_AA_make
Les nouveaux modules doivent pointer sur des repertoires source de NEMO, ne pas mettre les fichiers dans
$HOME/CONCEPTS_3.0.0/nemo3_1_cmc/modipsl/modeles/NEMO/WORK
(voir section gestion du code)
pour la configuration MPI, editer le fichier par_oce.F90
pour modifier un fichier, on doit d'abord en obtenir une copie locale en se servant de
NEMO_import.ksh
e.g. NEMO_import.ksh par_oce.F90