Labo-Precision-T5600

Installation logiciels pour appareil

Installation qiime
sudo apt-get install qiime -y

installation fastx-toolkit

sudo apt-get install fasts-toolkit -y

Installation Mothur

sudo apt-get install mothur -y

Flash
Pour pouvoir installer le logiciel, il faut installer sur ubuntu des librairies
On ouvre un terminal sur linux. On tape 
sudo apt-get install zlib1g-dev
Download du logiciel . Voici le lien : [1].
On ouvre un terminal sur linux.
On copie le fichier dans le répertoire. /opt
cp FLASH-version /opt
tar -xzvf  Download FLASH-version.tar.gz
Normalement, il devrait créer un répertoire au nom du fichier.
On va aller dans le répertoire
cd FLASH-version
Pour compiler, on va faire.
make
Pour pouvoir y accéder, on crée un raccourci dans le /usr/bin
ln -s /opt/flash/flash /usr/bin/flash

Swarm
Pour pouvoir installer le logiciel, on doit faire quelques étapes de préparation.
On doit créer un fichier dans répertoire /etc/apt/sources.list.d/ appeler perforce.list contenant cet information.
deb http://package.perforce.com/apt/ubuntu/ trusty release
Ensuite, on doit taper sur le terminal,les commandes suivantes.
wget -qO - https://package.perforce.com/perforce.pubkey | sudo apt-key add -
sudo apt-get update
Et enfin on installe.
sudo apt-get install helix-swarm helix-swarm-triggers helix-swarm-optional

Usearch 
Downloads Voici le lien [2][Usearch]
Par la suite, on copie le fichier.
cp usearch9.2.64_i86linux32  /usr/bin/
on lui donne les permission pour qui soit exécutable
chmod +x  /usr/bin/usearch9.2.64_i86linux32